Digitale Bibliotheek
Sluiten Bladeren door artikelen uit een tijdschrift
<< vorige    volgende >>
     Tijdschrift beschrijving
       Alle jaargangen van het bijbehorende tijdschrift
         Alle afleveringen van het bijbehorende jaargang
           Alle artikelen van de bijbehorende aflevering
                                       Details van artikel 6 van 10 gevonden artikelen
  Integration of Enzyme Kinetic Data from Various Sources
Titel: Integration of Enzyme Kinetic Data from Various Sources
Auteur: Borger, Simon
Uhlendorf, Jannis
Helbig, Anselm
Liebermeister, Wolfram
Verschenen in: In silico biology
Paginering: Jaargang 7 (2007) nr. supplement-2 pagina's 73-79
Jaar: 2007-05-30
Inhoud: We describe a workflow to translate a given metabolic network into a kinetic model; the model summarises kinetic information collected from different data sources. All reactions are modelled by convenience kinetics; where detailed kinetic laws are known, they can also be incorporated. Confidence intervals and correlations of the resulting model parameters are obtained from Bayesian parameter estimation; they can be used to sample parameter sets for Monte-Carlo simulations. The integration method ensures that the resulting parameter distributions are thermodynamically feasible. Here we summarise different previous works on this topic: we give an overview over the convenience kinetics, thermodynamic criteria for parameter sets, Bayesian parameter estimation, the collection of kinetic data, and different machine learning techniques that can be used to obtain prior distributions for kinetic parameters. All methods have been assembled into a workflow that facilitates the integration of biochemical data and the modelling of metabolic networks from scratch.
Uitgever: IOS Press
Bronbestand: Elektronische Wetenschappelijke Tijdschriften

                             Details van artikel 6 van 10 gevonden artikelen
<< vorige    volgende >>
 Koninklijke Bibliotheek - Nationale Bibliotheek van Nederland