Digitale Bibliotheek
Sluiten Bladeren door artikelen uit een tijdschrift
 
<< vorige    volgende >>
     Tijdschrift beschrijving
       Alle jaargangen van het bijbehorende tijdschrift
         Alle afleveringen van het bijbehorende jaargang
           Alle artikelen van de bijbehorende aflevering
                                       Details van artikel 4 van 10 gevonden artikelen
 
 
  HBAT: A Complete Package for Analysing Strong and Weak Hydrogen Bonds in Macromolecular Crystal Structures
 
 
Titel: HBAT: A Complete Package for Analysing Strong and Weak Hydrogen Bonds in Macromolecular Crystal Structures
Auteur: Tiwari, Abhishek
Panigrahi, Sunil K.
Verschenen in: In silico biology
Paginering: Jaargang 7 (2008) nr. 6 pagina's 651-661
Jaar: 2008-03-25
Inhoud: The program HBAT is a tool to automate the analysis of potential hydrogen bonds and similar type of weak interactions like halogen bonds and non-canonical interactions in macromolecular structures, available in Brookhaven Protein Database (PDB) file format. HBAT is written using PERL and TK languages. The program generates an MSOFFICE Excel compatible output file for statistical analysis. HBAT identify potential interactions based on geometrical criteria. A series of analysis reports like frequency tables, geometry distribution tables, furcations list are generated. A user friendly GUI offers freedom to select several parameters and options. Graphviz based visualization of hydrogen bond networks in 2D helps to study the cooperativity and anticooperativity geometry in hydrogen bond. HBAT supports post docking interaction analysis between PDB files for any target/receptor (in PDB files) and docked ligands/poses (in SDF). This tool can be implemented in active site interaction analysis, structure based drug design and molecular dynamics simulations.
Uitgever: IOS Press
Bronbestand: Elektronische Wetenschappelijke Tijdschriften
 
 

                             Details van artikel 4 van 10 gevonden artikelen
 
<< vorige    volgende >>
 
 Koninklijke Bibliotheek - Nationale Bibliotheek van Nederland