|
| << vorige | volgende >> |
Tijdschrift beschrijving
Alle jaargangen van het bijbehorende tijdschrift
Alle afleveringen van het bijbehorende jaargang
Alle artikelen van de bijbehorende aflevering
Details van artikel 2 van 11 gevonden artikelen
| Titel: |
Evolved Cellular Automata for Protein Secondary Structure Prediction Imitate the Determinants for Folding Observed in Nature |
| Auteur: |
Chopra, Paras Bender, Andreas |
| Verschenen in: |
In silico biology |
| Paginering: | Jaargang 7 (2007) nr. 1 pagina's 87-93 |
| Jaar: |
2007-05-21 |
| Inhoud: |
We demonstrate the first application of cellular automata to the secondary structure predictions of proteins. Cellular automata use localized interactions to simulate global phenomena, which resembles the protein folding problem where individual residues interact locally to define the global protein conformation. The protein's amino acid sequence was input into the cellular automaton and rules for updating states were evolved using a genetic algorithm. An optimized accuracy (Q3) for the RS126 and CB513 dataset of 58.21% and 56.51%, respectively, could be obtained. Thus, the current work demonstrates the applicability of a rather simple algorithm on a problem as complex as protein secondary structure prediction. |
| Uitgever: |
IOS Press |
| Bronbestand: |
Elektronische Wetenschappelijke Tijdschriften |
Details van artikel 2 van 11 gevonden artikelen
| << vorige | volgende >> |