Digitale Bibliotheek
Sluiten Bladeren door artikelen uit een tijdschrift
 
<< vorige    volgende >>
     Tijdschrift beschrijving
       Alle jaargangen van het bijbehorende tijdschrift
         Alle afleveringen van het bijbehorende jaargang
           Alle artikelen van de bijbehorende aflevering
                                       Details van artikel 6 van 11 gevonden artikelen
 
 
  In Silico Modeling and Hydrogen Peroxide Binding Study of Rice Catalase
 
 
Titel: In Silico Modeling and Hydrogen Peroxide Binding Study of Rice Catalase
Auteur: Sekhar, Pagadala Nataraj
Kishor, Polavarapu B. Kavi
Reddy, Lakkireddy Ananda
Mondal, Prosenjit
Dash, Ardhendu K.
Kar, Manoranjan
Mohanty, Satya
Sabat, Surendra C.
Verschenen in: In silico biology
Paginering: Jaargang 6 (2006) nr. 5 pagina's 435-447
Jaar: 2006-12-01
Inhoud: Homology modeling of the catalase, CatC cloned and sequenced from rice (Oryza sativa L., cv Ratna an Indica cultivar) has been performed based on the crystal structure of the catalase CatF (PDB code 1m7s) by using the software MODELLER. With the aid of molecular mechanics and molecular dynamics methods, the final model is obtained and is further assessed by PROCHECK and VERIFY - 3D graph, which show that the final refined model is reliable. With this model, a flexible docking study with the hydrogen peroxide, the substrate for catalase, is performed and the results indicate that Arg310, Asp343 and Arg346 in catalase are three important determinant residues in binding as they have strong hydrogen bonding contacts with the substrate. These hydrogen-bonding interactions play an important role for the stability of the complex. Our results may be helpful for further experimental investigations.
Uitgever: IOS Press
Bronbestand: Elektronische Wetenschappelijke Tijdschriften
 
 

                             Details van artikel 6 van 11 gevonden artikelen
 
<< vorige    volgende >>
 
 Koninklijke Bibliotheek - Nationale Bibliotheek van Nederland