Digitale Bibliotheek
Sluiten Bladeren door artikelen uit een tijdschrift
<< vorige    volgende >>
     Tijdschrift beschrijving
       Alle jaargangen van het bijbehorende tijdschrift
         Alle afleveringen van het bijbehorende jaargang
           Alle artikelen van de bijbehorende aflevering
                                       Details van artikel 5 van 14 gevonden artikelen
  DNA Motifs and Sequence Periodicities
Titel: DNA Motifs and Sequence Periodicities
Auteur: Kumar, Lokesh
Futschik, Matthias
Herzel, Hanspeter
Verschenen in: In silico biology
Paginering: Jaargang 6 (2006) nr. 1-2 pagina's 71-78
Jaar: 2006-07-05
Inhoud: Genomic DNA sequences contain a wealth of information about the bendability and curvature of the DNA molecule. For example, the well-known 10-11 bp periodicities within genomes can be attributed to supercoiled structures or wrapping around nucleosomes. Such periodic signals have previously been examined mainly based on mono- or dinucleotide correlations. In this study, we generalize this approach and analyze correlation functions of longer motifs such as tetramers or poly(A) sequences. Periodically placed motifs may indicate regular protein binding or curvature signals. We detected various periodic signals e.g. strong 10-11 bp oscillations of periodically placed poly(A), poly(T) or poly(W) stretches. These observations lead to a new view on the intensively studied 10-11 bp periodicities.
Uitgever: IOS Press
Bronbestand: Elektronische Wetenschappelijke Tijdschriften

                             Details van artikel 5 van 14 gevonden artikelen
<< vorige    volgende >>
 Koninklijke Bibliotheek - Nationale Bibliotheek van Nederland