|
| << vorige | volgende >> |
Tijdschrift beschrijving
Alle jaargangen van het bijbehorende tijdschrift
Alle afleveringen van het bijbehorende jaargang
Alle artikelen van de bijbehorende aflevering
Details van artikel 8 van 25 gevonden artikelen
| Titel: |
Comparing Bound and Unbound Protein Structures Using Energy Calculation and Rotamer Statistics |
| Auteur: |
Koch, Kerstin Zöllner, Frank Neumann, Steffen Kummert, Franz Sagerer, Gerhard |
| Verschenen in: |
In silico biology |
| Paginering: | Jaargang 2 (2002) nr. 3 pagina's 351-368 |
| Jaar: |
2002-12-28 |
| Inhoud: |
Protein data in the PDB covers only a snapshot of a protein structure. For flexible docking conformational changes need to be considered. Rotamer statistics provide the likelihood for side chain conformations, and further comparison of bound and unbound state yields differences in preferred positions. Furthermore, we do a full sampling of selected χ angles and apply the AMBER force field. Conformation of energy minima complies with the rotamer statistics. Both types of information target the reduction of search space for enumerative docking algorithms and provide parameters for elastic docking. |
| Uitgever: |
IOS Press |
| Bronbestand: |
Elektronische Wetenschappelijke Tijdschriften |
Details van artikel 8 van 25 gevonden artikelen
| << vorige | volgende >> |