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| Titel: |
Secuencia del genoma de un aislamiento del virus de la tristeza de los cítricos |
| Auteur: |
Alberto Mendoza Herrera Jesús Di Carlo Quiroz Velásquez Ma. Antonia Cruz Hernández Ma. de los Ángeles Peña del Río Maurilio González Paz Susana Fernández Dávila |
| Verschenen in: |
Revista fitotecnia mexicana |
| Paginering: | Jaargang 31 (2008) nr. 2 pagina's 95-104 |
| Jaar: |
2008 |
| Inhoud: |
El genoma de un aislamiento severo del virus de la tristeza de los cítricos (VTC) de México (CBG-VTC1) se secuenció en su totalidad. Los 19 300 nucleótidos (nt) del genoma se dividen en 12 marcos de lectura abierta (ORF¿s) que codifican para 15 proteínas y dos regiones no traducibles (5¿ y 3¿-UTR). El primer marco de lectura abierta inició en el nucleótido 108 con un tamaño de 9587 nt, y codificó para tres proteínas traslapadas, una poliproteína de 357 kDa que contiene dos proteasas contiguas (P-PRO), una metiltransferasa (MTR) y una helicasa (HEL). El segundo ORF traslapó en los últimos 55 nt de las proteasas; éste codifica para una ARN polimerasa ARN-dependiente (RdRp) con un peso molecular de 47 kDa cuya función es la replicación. Los ORF¿s del 2 al 10 codificaron 10 productos proteicos con un rango que va de 6 a 65 kDa. El genoma CBG-VTC1 presentó sintenia con genomas ya reportados, y difirió solamente en 2 a 74 nt. La región 5¿-UTR del CBG-VTC1 mostró 55 % de identidad con T30, 57.9 % con SY568, 100 % con T36 y solamente 58.9 % con VT, mientras que la región 3¿-UTR tuvo 96 % de identidad en todos los aislamientos. La identidad aminoacídica promedio fue de 87.0 % con un aislamiento débil (T30) y de 85.9 %, 93.7 % y 85.13 % con las razas severas SY568, T36 y VT, respectivamente. |
| Uitgever: |
Sociedad Mexicana de Fitogenética (provided by DOAJ) |
| Bronbestand: |
Elektronische Wetenschappelijke Tijdschriften |
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