|
| << vorige | volgende >> |
Tijdschrift beschrijving
Alle jaargangen van het bijbehorende tijdschrift
Alle afleveringen van het bijbehorende jaargang
Alle artikelen van de bijbehorende aflevering
Details van artikel 13 van 64 gevonden artikelen
| Titel: |
DYNGA: a general purpose QM-MM-MD program. I. Application to water |
| Auteur: |
PARKER, CLAUDIA L. VENTURA, OSCAR N. BURT, STAN K. CACHAU, RAUL E. |
| Verschenen in: |
Molecular physics |
| Paginering: | Jaargang 101 (2003) nr. 17 pagina's 2659-2668 |
| Jaar: |
2003-09-10 |
| Inhoud: |
We present a general purpose QM-MM-MD engine (DYNGA) designed to test alternative hybrid Hamiltonians geared towards the treatment of problems of interest in structural biology including the use of experimental data constraints. In this first presentation we use DYNGA to explore the behaviour of a traditional QM-MM approach in the treatment of the water—water interaction. We find the potential energy hypersurface for the water dimer computed with the HF 4-31G*/TIP3P hybrid Hamiltonian tends to be too flat. We also explore the effect of using traditional QM-MM techniques on proton wires and conclude there is a need for improvement, possibly addressed by using polarizable force fields. |
| Uitgever: |
Taylor & Francis |
| Bronbestand: |
Elektronische Wetenschappelijke Tijdschriften |
Details van artikel 13 van 64 gevonden artikelen
| << vorige | volgende >> |